Izvedba apoptoze

Čeprav natančen mehanizem procesa apoptoze ni popolnoma jasen, je bilo ugotovljeno, da ima kaspaza, in sicer kaspaza, bistveno vlogo v procesu apoptoze. Proces celične apoptoze je pravzaprav kaskadni reakcijski proces pomnoževanja ireverzibilne in omejene hidrolize substrata kaspaze. Doslej so našli vsaj 14 kaspaz. Molekule kaspaze imajo visoko homologijo in podobno strukturo, vse so proteaze družine cisteina. Kaspaze lahko v bistvu razdelimo v dve kategoriji glede na njihove funkcije: ena je vključena v procesiranje celic, kot je Pro-IL-1 in Pro- IL-1 δ, tvorba aktivnega IL-1 in IL-1 δ; Drugi tip je vključen v celično apoptozo, vključno s kaspazo2,3,6,7,8,9.10. Družina kaspaz ima na splošno naslednje značilnosti:

1) Obstaja mesto za aktiviranje cisteina v homologni regiji C-terminala in ta domena mesta za aktiviranje je QACR/QG.

2) Običajno obstaja v obliki zimogena z relativno molekulsko maso 29000-49000 (29-49KD). Po aktivaciji se njeni notranji konzervativni ostanki asparaginske kisline hidrolizirajo v dve veliki (P20) in majhni (P10) podenoti, nato pa tvorijo aktivni tetramer, sestavljen iz dveh parov. Vsak P20/P10 heterodimer je lahko izpeljan iz iste prekurzorske molekule ali dveh različnih prekurzorskih molekul.

3) Konec ima majhno ali veliko izvirno domeno.

Kaspaze, vključene v indukcijo apoptoze, spadajo v dve kategoriji: iniciatorji in efektorji, ki igrajo vlogo pri prenosu signala smrti navzgor in navzdol.